本片讲述了狄仁杰在一片乱局一种受命调查通天教主奇案，一路上历经艰险，凭借聪明才智破解了真相，救出了被绑架的武则天，并拆穿通天教主的真身，挽留了国家于为难的故事。。清河县一老人莫名自燃身亡，经仵作赵鹏查探，发现此事与客栈老板于铭为牟取暴利、假借长生之名售卖“长生丹”有关。后又发生多起自燃案，经调查取证，竟是药师范广清为追求长生邪术，不惜拿百姓做实验，最终受到了应有惩罚。。
